MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia pseudomallei 1106a chromosome II

Total Repeats: 102416

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009078	CGA	2	6	9	14	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126455556
2	NC_009078	ATCC	2	8	24	31	25 %	25 %	0 %	50 %	126455556
3	NC_009078	GAA	2	6	34	39	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126455556
4	NC_009078	TGCGC	2	10	45	54	0 %	20 %	40 %	40 %	126455556
5	NC_009078	TTC	2	6	106	111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126455556
6	NC_009078	GCGA	2	8	169	176	25 %	0 %	50 %	25 %	126455556
7	NC_009078	GGC	2	6	243	248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126455556
8	NC_009078	GAA	2	6	265	270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126455556
9	NC_009078	GC	3	6	278	283	0 %	0 %	50 %	50 %	126455556
10	NC_009078	GC	3	6	290	295	0 %	0 %	50 %	50 %	126455556
11	NC_009078	GAA	2	6	301	306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126455556
12	NC_009078	GCA	2	6	345	350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126455556
13	NC_009078	AGC	2	6	355	360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126455556
14	NC_009078	GGC	3	9	366	374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126455556
15	NC_009078	CG	4	8	441	448	0 %	0 %	50 %	50 %	126455556
16	NC_009078	GCC	2	6	464	469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126455556
17	NC_009078	GAAAAT	2	12	556	567	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	126455556
18	NC_009078	GCT	2	6	570	575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126455556
19	NC_009078	CGC	2	6	609	614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126455556
20	NC_009078	GCA	2	6	675	680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126455556
21	NC_009078	GCG	2	6	708	713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126455556
22	NC_009078	TCG	2	6	728	733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126455556
23	NC_009078	GCA	2	6	749	754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126455556
24	NC_009078	CAA	2	6	814	819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126455556
25	NC_009078	GC	4	8	835	842	0 %	0 %	50 %	50 %	126455556
26	NC_009078	AGCC	2	8	918	925	25 %	0 %	25 %	50 %	126455556
27	NC_009078	CGC	2	6	945	950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126455556
28	NC_009078	CGC	3	9	987	995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126455556
29	NC_009078	GCG	2	6	1058	1063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126455556
30	NC_009078	ACG	2	6	1085	1090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126455556
31	NC_009078	GCC	4	12	1156	1167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126455556
32	NC_009078	ACA	2	6	1180	1185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126455556
33	NC_009078	TGGCT	2	10	1289	1298	0 %	40 %	40 %	20 %	126458031
34	NC_009078	TTC	2	6	1364	1369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126458031
35	NC_009078	CGA	2	6	1390	1395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458031
36	NC_009078	GTGCG	2	10	1500	1509	0 %	20 %	60 %	20 %	126458031
37	NC_009078	CGA	2	6	1533	1538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458031
38	NC_009078	CG	3	6	1549	1554	0 %	0 %	50 %	50 %	126458031
39	NC_009078	TCG	2	6	1560	1565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458031
40	NC_009078	ACG	2	6	1671	1676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458031
41	NC_009078	CG	3	6	1689	1694	0 %	0 %	50 %	50 %	126458031
42	NC_009078	GCC	2	6	1709	1714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458031
43	NC_009078	CCG	3	9	1787	1795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458031
44	NC_009078	GC	3	6	1812	1817	0 %	0 %	50 %	50 %	126458031
45	NC_009078	TTCC	2	8	1828	1835	0 %	50 %	0 %	50 %	126458031
46	NC_009078	GCGCC	2	10	1839	1848	0 %	0 %	40 %	60 %	126458031
47	NC_009078	AGC	2	6	1880	1885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458031
48	NC_009078	GCG	2	6	1886	1891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458031
49	NC_009078	TCG	2	6	1914	1919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458031
50	NC_009078	CG	4	8	1929	1936	0 %	0 %	50 %	50 %	126458031
51	NC_009078	GC	3	6	1937	1942	0 %	0 %	50 %	50 %	126458031
52	NC_009078	TCG	2	6	1983	1988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458031
53	NC_009078	TCT	2	6	2058	2063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126458031
54	NC_009078	CGA	2	6	2079	2084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458031
55	NC_009078	AGCC	2	8	2138	2145	25 %	0 %	25 %	50 %	126458031
56	NC_009078	GC	3	6	2163	2168	0 %	0 %	50 %	50 %	126458031
57	NC_009078	GAC	2	6	2183	2188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458031
58	NC_009078	GCCA	2	8	2207	2214	25 %	0 %	25 %	50 %	126458031
59	NC_009078	GCG	2	6	2289	2294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458031
60	NC_009078	TCA	2	6	2350	2355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009078	CGG	3	9	2407	2415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009078	CCG	2	6	2421	2426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_009078	CAT	2	6	2438	2443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009078	CG	3	6	2448	2453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009078	GCG	2	6	2477	2482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009078	GC	3	6	2501	2506	0 %	0 %	50 %	50 %	126457336
67	NC_009078	CGGCA	2	10	2527	2536	20 %	0 %	40 %	40 %	126457336
68	NC_009078	GC	4	8	2546	2553	0 %	0 %	50 %	50 %	126457336
69	NC_009078	CGA	2	6	2625	2630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126457336
70	NC_009078	TCG	2	6	2633	2638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126457336
71	NC_009078	GCCTCG	2	12	2726	2737	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126457336
72	NC_009078	GCA	2	6	2745	2750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126457336
73	NC_009078	GCC	2	6	2751	2756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126457336
74	NC_009078	GCC	2	6	2939	2944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_009078	GC	3	6	3029	3034	0 %	0 %	50 %	50 %	126456620
76	NC_009078	CGCC	2	8	3040	3047	0 %	0 %	25 %	75 %	126456620
77	NC_009078	GCC	2	6	3052	3057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126456620
78	NC_009078	CGC	2	6	3068	3073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126456620
79	NC_009078	GC	3	6	3145	3150	0 %	0 %	50 %	50 %	126456620
80	NC_009078	TCG	2	6	3312	3317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126456620
81	NC_009078	GCC	2	6	3343	3348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126456620
82	NC_009078	TCG	2	6	3361	3366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126456620
83	NC_009078	CGG	2	6	3415	3420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126456620
84	NC_009078	CG	3	6	3421	3426	0 %	0 %	50 %	50 %	126456620
85	NC_009078	TCG	2	6	3432	3437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126456620
86	NC_009078	CGG	2	6	3488	3493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126456620
87	NC_009078	CG	3	6	3534	3539	0 %	0 %	50 %	50 %	126456620
88	NC_009078	GTT	2	6	3577	3582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226830785
89	NC_009078	GCC	3	9	3663	3671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226830785
90	NC_009078	CG	3	6	3782	3787	0 %	0 %	50 %	50 %	226830785
91	NC_009078	GGC	2	6	3829	3834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226830785
92	NC_009078	CGG	2	6	3850	3855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226830785
93	NC_009078	CACG	2	8	3856	3863	25 %	0 %	25 %	50 %	226830785
94	NC_009078	AAC	2	6	3881	3886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226830785
95	NC_009078	CGC	3	9	3919	3927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226830785
96	NC_009078	GGC	2	6	3931	3936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226830785
97	NC_009078	AGC	2	6	4002	4007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226830785
98	NC_009078	CGA	2	6	4039	4044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226830785
99	NC_009078	GCT	2	6	4062	4067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226830785
100	NC_009078	CGG	2	6	4078	4083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226830785
101	NC_009078	GCT	2	6	4096	4101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226830785
102	NC_009078	CGA	2	6	4102	4107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226830785
103	NC_009078	ACG	2	6	4110	4115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226830785
104	NC_009078	ATC	2	6	4118	4123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226830785
105	NC_009078	CGA	2	6	4126	4131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226830785
106	NC_009078	CAT	2	6	4147	4152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226830785
107	NC_009078	AAC	2	6	4196	4201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226830785
108	NC_009078	CGG	2	6	4242	4247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226830785
109	NC_009078	GC	4	8	4248	4255	0 %	0 %	50 %	50 %	226830785
110	NC_009078	CGAC	2	8	4269	4276	25 %	0 %	25 %	50 %	226830785
111	NC_009078	CAT	2	6	4297	4302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226830785
112	NC_009078	GC	3	6	4344	4349	0 %	0 %	50 %	50 %	226830785
113	NC_009078	CGA	2	6	4360	4365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226830785
114	NC_009078	GCG	2	6	4419	4424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226830785
115	NC_009078	GCG	2	6	4473	4478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226830785
116	NC_009078	CG	3	6	4498	4503	0 %	0 %	50 %	50 %	226830785
117	NC_009078	TCG	2	6	4512	4517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226830785
118	NC_009078	GCT	2	6	4519	4524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226830785
119	NC_009078	CGA	2	6	4615	4620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226830785
120	NC_009078	GC	4	8	4623	4630	0 %	0 %	50 %	50 %	226830785
121	NC_009078	GC	3	6	4645	4650	0 %	0 %	50 %	50 %	226830785
122	NC_009078	GC	3	6	4656	4661	0 %	0 %	50 %	50 %	226830785
123	NC_009078	AGA	2	6	4671	4676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226830785
124	NC_009078	GCG	2	6	4682	4687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226830785
125	NC_009078	GCT	2	6	4771	4776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226830785
126	NC_009078	CG	3	6	4821	4826	0 %	0 %	50 %	50 %	226830785
127	NC_009078	CG	4	8	4829	4836	0 %	0 %	50 %	50 %	226830785
128	NC_009078	CGCA	2	8	4841	4848	25 %	0 %	25 %	50 %	226830785
129	NC_009078	CG	3	6	4866	4871	0 %	0 %	50 %	50 %	226830785
130	NC_009078	GATC	2	8	4876	4883	25 %	25 %	25 %	25 %	226830785
131	NC_009078	CGGGC	2	10	4972	4981	0 %	0 %	60 %	40 %	126458436
132	NC_009078	ACG	2	6	5022	5027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458436
133	NC_009078	TCA	2	6	5031	5036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126458436
134	NC_009078	CCG	2	6	5041	5046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458436
135	NC_009078	GAC	2	6	5087	5092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458436
136	NC_009078	AGA	2	6	5100	5105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126458436
137	NC_009078	TCG	2	6	5151	5156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458436
138	NC_009078	CG	3	6	5243	5248	0 %	0 %	50 %	50 %	126458436
139	NC_009078	GCG	2	6	5251	5256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458436
140	NC_009078	CGA	2	6	5365	5370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458436
141	NC_009078	CGC	2	6	5374	5379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458436
142	NC_009078	TCG	2	6	5430	5435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458436
143	NC_009078	GC	4	8	5505	5512	0 %	0 %	50 %	50 %	126458436
144	NC_009078	CGT	2	6	5515	5520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458436
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146	NC_009078	CG	3	6	5576	5581	0 %	0 %	50 %	50 %	126458436
147	NC_009078	CG	3	6	5592	5597	0 %	0 %	50 %	50 %	126458436
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150	NC_009078	GCT	2	6	5725	5730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458436
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155	NC_009078	CGCAT	2	10	6064	6073	20 %	20 %	20 %	40 %	126457544
156	NC_009078	CG	3	6	6088	6093	0 %	0 %	50 %	50 %	126457544
157	NC_009078	CG	3	6	6125	6130	0 %	0 %	50 %	50 %	126457544
158	NC_009078	TGC	2	6	6147	6152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126457544
159	NC_009078	CG	4	8	6200	6207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
160	NC_009078	A	6	6	6217	6222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_009078	A	6	6	6229	6234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_009078	GCG	2	6	6253	6258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_009078	GACG	2	8	6273	6280	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
164	NC_009078	TTC	2	6	6289	6294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_009078	TGCG	2	8	6302	6309	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
166	NC_009078	CCTT	2	8	6338	6345	0 %	50 %	0 %	50 %	126457736
167	NC_009078	GCGCAC	2	12	6364	6375	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126457736
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169	NC_009078	GC	3	6	6417	6422	0 %	0 %	50 %	50 %	126457736
170	NC_009078	GC	3	6	6574	6579	0 %	0 %	50 %	50 %	126457736
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172	NC_009078	CGA	2	6	6642	6647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126457736
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264	NC_009078	ATC	2	6	9358	9363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126455860
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266	NC_009078	TCGA	2	8	9457	9464	25 %	25 %	25 %	25 %	126455860
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269	NC_009078	GC	5	10	9654	9663	0 %	0 %	50 %	50 %	126455860
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273	NC_009078	CG	3	6	9782	9787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
274	NC_009078	CGA	2	6	9817	9822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126457861
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400	NC_009078	CGC	2	6	14438	14443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126457661
401	NC_009078	CGC	3	9	14448	14456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126457661
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482	NC_009078	AGC	2	6	17440	17445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458128
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486	NC_009078	GCC	2	6	17556	17561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458128
487	NC_009078	GAAT	2	8	17639	17646	50 %	25 %	25 %	0 %	126458128
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